Protein–RNA interactions for Protein: P62984

Uba52, Ubiquitin-60S ribosomal protein L40, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba52P62984 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Uba52P62984 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Uba52P62984 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Uba52P62984 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Uba52P62984 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Uba52P62984 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms