Protein–RNA interactions for Protein: P62889

Rpl30, 60S ribosomal protein L30, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl30P62889 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rpl30P62889 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.7 ms