Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gnb1P62874 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Gnb1P62874 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms