Protein–RNA interactions for Protein: P62821

Rab1A, Ras-related protein Rab-1A, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab1AP62821 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rab1AP62821 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rab1AP62821 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms