Protein–RNA interactions for Protein: P62737

Acta2, Actin, aortic smooth muscle, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acta2P62737 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta2P62737 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta2P62737 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Acta2P62737 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta2P62737 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta2P62737 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Acta2P62737 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms