Protein–RNA interactions for Protein: P62315

Snrpd1, Small nuclear ribonucleoprotein Sm D1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpd1P62315 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Snrpd1P62315 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Snrpd1P62315 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms