Protein–RNA interactions for Protein: P62281

Rps11, 40S ribosomal protein S11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 158 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps11P62281 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rps11P62281 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rps11P62281 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms