Protein–RNA interactions for Protein: P60191

Rims4, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims4P60191 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Rims4P60191 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms