Protein–RNA interactions for Protein: P59328

Wdhd1, WD repeat and HMG-box DNA-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdhd1P59328 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdhd1P59328 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdhd1P59328 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdhd1P59328 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdhd1P59328 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdhd1P59328 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdhd1P59328 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdhd1P59328 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Wdhd1P59328 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Wdhd1P59328 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Mtg1-201ENSMUST00000036977 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Wdhd1P59328 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Wdhd1P59328 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms