Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Csrnp3P59055 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Csrnp3P59055 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms