Protein–RNA interactions for Protein: P58873

Rhbdl3, Rhomboid-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl3P58873 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rhbdl3P58873 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rhbdl3P58873 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms