Protein–RNA interactions for Protein: P58686

UPF0184 protein C9orf16 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 83 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P58686 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P58686 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P58686 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
P58686 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P58686 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P58686 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P58686 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
P58686 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
P58686 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
P58686 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
P58686 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P58686 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P58686 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P58686 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
P58686 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P58686 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P58686 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P58686 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P58686 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P58686 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P58686 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
P58686 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P58686 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P58686 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P58686 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P58686 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
P58686 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P58686 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P58686 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P58686 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P58686 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P58686 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P58686 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
P58686 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
P58686 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P58686 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P58686 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P58686 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P58686 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
P58686 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P58686 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
P58686 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
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P58686 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
P58686 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
P58686 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms