Protein–RNA interactions for Protein: P58501

Paxbp1, PAX3- and PAX7-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Paxbp1P58501 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Paxbp1P58501 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Paxbp1P58501 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Paxbp1P58501 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Paxbp1P58501 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Paxbp1P58501 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Paxbp1P58501 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Paxbp1P58501 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms