Protein–RNA interactions for Protein: P57725

Samsn1, SAM domain-containing protein SAMSN-1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samsn1P57725 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Samsn1P57725 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Anks3-201ENSMUST00000023157 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Gm26694-201ENSMUST00000180868 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Samsn1P57725 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms