Protein–RNA interactions for Protein: P56857

Cldn18, Claudin-18, mousemouse

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn18P56857 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cldn18P56857 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Ap2m1-202ENSMUST00000090023 2080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cldn18P56857 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
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