Protein–RNA interactions for Protein: P56388

Cartpt, Cocaine- and amphetamine-regulated transcript protein, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CartptP56388 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CartptP56388 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CartptP56388 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
CartptP56388 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
CartptP56388 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CartptP56388 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CartptP56388 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CartptP56388 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CartptP56388 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CartptP56388 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CartptP56388 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
CartptP56388 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
CartptP56388 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
CartptP56388 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CartptP56388 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CartptP56388 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CartptP56388 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CartptP56388 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CartptP56388 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CartptP56388 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CartptP56388 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CartptP56388 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CartptP56388 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CartptP56388 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CartptP56388 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CartptP56388 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CartptP56388 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CartptP56388 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
CartptP56388 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CartptP56388 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CartptP56388 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CartptP56388 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CartptP56388 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CartptP56388 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CartptP56388 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CartptP56388 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CartptP56388 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CartptP56388 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
CartptP56388 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CartptP56388 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CartptP56388 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
CartptP56388 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CartptP56388 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
CartptP56388 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CartptP56388 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CartptP56388 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CartptP56388 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CartptP56388 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CartptP56388 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CartptP56388 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CartptP56388 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CartptP56388 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
CartptP56388 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
CartptP56388 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CartptP56388 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CartptP56388 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
CartptP56388 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CartptP56388 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CartptP56388 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CartptP56388 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CartptP56388 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CartptP56388 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CartptP56388 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
CartptP56388 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
CartptP56388 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms