Protein–RNA interactions for Protein: P55098

Pex2, Peroxisome biogenesis factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pex2P55098 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Pex2P55098 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pex2P55098 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Pex2P55098 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pex2P55098 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pex2P55098 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pex2P55098 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pex2P55098 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pex2P55098 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Pex2P55098 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms