Protein–RNA interactions for Protein: P55096

Abcd3, ATP-binding cassette sub-family D member 3, mousemouse

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcd3P55096 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Abcd3P55096 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms