Protein–RNA interactions for Protein: P54726

Rad23a, UV excision repair protein RAD23 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad23aP54726 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Nbl1-201ENSMUST00000042844 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Rad23aP54726 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Rad23aP54726 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms