Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PctpP53808 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PctpP53808 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PctpP53808 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PctpP53808 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PctpP53808 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PctpP53808 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PctpP53808 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PctpP53808 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
PctpP53808 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
PctpP53808 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
PctpP53808 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PctpP53808 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PctpP53808 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PctpP53808 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PctpP53808 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PctpP53808 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PctpP53808 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
PctpP53808 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PctpP53808 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PctpP53808 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
PctpP53808 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PctpP53808 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PctpP53808 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PctpP53808 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PctpP53808 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
PctpP53808 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
PctpP53808 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PctpP53808 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PctpP53808 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PctpP53808 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PctpP53808 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PctpP53808 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PctpP53808 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PctpP53808 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
PctpP53808 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PctpP53808 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PctpP53808 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
PctpP53808 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
PctpP53808 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
PctpP53808 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms