Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 B4gat1-201ENSMUST00000053705 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Fdft1P53798 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Fdft1P53798 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms