Protein–RNA interactions for Protein: P52795

Efnb1, Ephrin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 345 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efnb1P52795 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Efnb1P52795 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Efnb1P52795 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms