Protein–RNA interactions for Protein: P51655

Gpc4, Glypican-4, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpc4P51655 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gpc4P51655 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gpc4P51655 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms