Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

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Length 591 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FanccP50652 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
FanccP50652 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FanccP50652 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FanccP50652 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
FanccP50652 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FanccP50652 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FanccP50652 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FanccP50652 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
FanccP50652 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FanccP50652 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FanccP50652 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
FanccP50652 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FanccP50652 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FanccP50652 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FanccP50652 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FanccP50652 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FanccP50652 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
FanccP50652 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FanccP50652 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FanccP50652 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FanccP50652 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
FanccP50652 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FanccP50652 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
FanccP50652 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FanccP50652 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FanccP50652 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
FanccP50652 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FanccP50652 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
FanccP50652 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
FanccP50652 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
FanccP50652 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FanccP50652 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FanccP50652 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
FanccP50652 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
FanccP50652 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FanccP50652 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
FanccP50652 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanccP50652 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanccP50652 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanccP50652 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanccP50652 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanccP50652 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanccP50652 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanccP50652 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanccP50652 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanccP50652 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
FanccP50652 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanccP50652 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanccP50652 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanccP50652 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanccP50652 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanccP50652 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanccP50652 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanccP50652 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanccP50652 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanccP50652 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanccP50652 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
FanccP50652 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FanccP50652 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FanccP50652 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FanccP50652 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FanccP50652 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FanccP50652 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
FanccP50652 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
FanccP50652 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
FanccP50652 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FanccP50652 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
FanccP50652 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms