Protein–RNA interactions for Protein: P50220

Nkx2-1, Homeobox protein Nkx-2.1, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx2-1P50220 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Rad1-201ENSMUST00000022856 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Adgrv1-211ENSMUST00000146749 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Gpc3-202ENSMUST00000114857 1880 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Nkx2-1P50220 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Nkx2-1P50220 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.3 ms