Protein–RNA interactions for Protein: P48787

Tnni3, Troponin I, cardiac muscle, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnni3P48787 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tnni3P48787 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tnni3P48787 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms