Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prox1P48437 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prox1P48437 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Prox1P48437 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prox1P48437 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Prox1P48437 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prox1P48437 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prox1P48437 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prox1P48437 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prox1P48437 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Prox1P48437 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms