Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VdrP48281 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VdrP48281 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VdrP48281 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VdrP48281 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VdrP48281 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VdrP48281 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VdrP48281 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VdrP48281 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VdrP48281 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VdrP48281 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VdrP48281 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VdrP48281 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VdrP48281 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
VdrP48281 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VdrP48281 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VdrP48281 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VdrP48281 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VdrP48281 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VdrP48281 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VdrP48281 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VdrP48281 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VdrP48281 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VdrP48281 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VdrP48281 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VdrP48281 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VdrP48281 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VdrP48281 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VdrP48281 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VdrP48281 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VdrP48281 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VdrP48281 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VdrP48281 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VdrP48281 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VdrP48281 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VdrP48281 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VdrP48281 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VdrP48281 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VdrP48281 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VdrP48281 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VdrP48281 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VdrP48281 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VdrP48281 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VdrP48281 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VdrP48281 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
VdrP48281 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VdrP48281 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VdrP48281 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VdrP48281 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VdrP48281 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VdrP48281 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 247.6 ms