Protein–RNA interactions for Protein: P47239

Pax7, Paired box protein Pax-7, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pax7P47239 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax7P47239 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax7P47239 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax7P47239 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax7P47239 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax7P47239 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax7P47239 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax7P47239 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax7P47239 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pax7P47239 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pax7P47239 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pax7P47239 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.4 ms