Protein–RNA interactions for Protein: P46686

Tulp2, Tubby-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 562 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tulp2P46686 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Mgarp-202ENSMUST00000108046 1409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Mdfi-201ENSMUST00000035375 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Snx20-201ENSMUST00000034087 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Tulp2P46686 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Tulp2P46686 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms