Protein–RNA interactions for Protein: P46414

Cdkn1b, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, mousemouse

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkn1bP46414 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Cdkn1bP46414 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Cdkn1bP46414 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms