Protein–RNA interactions for Protein: P42866

Oprm1, Mu-type opioid receptor, mousemouse

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Oprm1P42866 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Oprm1P42866 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Oprm1P42866 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.8 ms