Protein–RNA interactions for Protein: P41274

Tnfsf9, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 9, mousemouse

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Length 309 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf9P41274 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tnfsf9P41274 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
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Tnfsf9P41274 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Tnfsf9P41274 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
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Tnfsf9P41274 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
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Tnfsf9P41274 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Tnfsf9P41274 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
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