Protein–RNA interactions for Protein: P40336

Vps26a, Vacuolar protein sorting-associated protein 26A, mousemouse

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps26aP40336 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Vps26aP40336 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Vps26aP40336 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms