Protein–RNA interactions for Protein: P40226

Thpo, Thrombopoietin, mousemouse

Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ThpoP40226 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Pcyt2-201ENSMUST00000026129 1881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ThpoP40226 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ThpoP40226 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
ThpoP40226 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ThpoP40226 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ThpoP40226 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms