Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Ica1-203ENSMUST00000115519 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Slc25a10-201ENSMUST00000026899 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf2P39429 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Traf2P39429 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms