Protein–RNA interactions for Protein: P39428

Traf1, TNF receptor-associated factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf1P39428 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf1P39428 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf1P39428 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Traf1P39428 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf1P39428 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Traf1P39428 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Traf1P39428 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf1P39428 Nfe2-210ENSMUST00000156927 1608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Traf1P39428 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Traf1P39428 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Traf1P39428 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Traf1P39428 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Traf1P39428 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Impdh2-201ENSMUST00000081111 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Traf1P39428 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Traf1P39428 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf1P39428 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf1P39428 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf1P39428 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf1P39428 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Traf1P39428 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Traf1P39428 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf1P39428 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf1P39428 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf1P39428 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Traf1P39428 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf1P39428 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Traf1P39428 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Traf1P39428 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf1P39428 3830408C21Rik-206ENSMUST00000225489 1810 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf1P39428 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf1P39428 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Traf1P39428 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.7 ms