Protein–RNA interactions for Protein: P39087

Grik2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik2P39087 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Grik2P39087 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik2P39087 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik2P39087 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Grik2P39087 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Grik2P39087 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms