Protein–RNA interactions for Protein: P38585

Ttl, Tubulin--tyrosine ligase, mousemouse

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtlP38585 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TtlP38585 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TtlP38585 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
TtlP38585 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
TtlP38585 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
TtlP38585 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtlP38585 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtlP38585 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtlP38585 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtlP38585 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtlP38585 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtlP38585 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtlP38585 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtlP38585 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
TtlP38585 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Swsap1-201ENSMUST00000053583 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
TtlP38585 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
TtlP38585 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
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