Protein–RNA interactions for Protein: P38575

Upk2, Uroplakin-2, mousemouse

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk2P38575 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk2P38575 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Upk2P38575 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk2P38575 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Upk2P38575 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms