Protein–RNA interactions for Protein: P35689

Ercc5, DNA repair protein complementing XP-G cells homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc5P35689 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Ntmt1-201ENSMUST00000041830 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ercc5P35689 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc5P35689 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc5P35689 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc5P35689 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc5P35689 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc5P35689 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc5P35689 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ercc5P35689 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc5P35689 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc5P35689 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc5P35689 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc5P35689 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc5P35689 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ercc5P35689 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms