Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Rab20P35295 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab20P35295 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 6030445D17Rik-201ENSMUST00000084593 1728 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Rab20P35295 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms