Protein–RNA interactions for Protein: P35276

Rab3d, Ras-related protein Rab-3D, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3dP35276 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Rchy1-201ENSMUST00000031345 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Sigmar1-202ENSMUST00000071561 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Nol7-201ENSMUST00000071926 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rab3dP35276 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rab3dP35276 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms