Protein–RNA interactions for Protein: P33622

Apoc3, Apolipoprotein C-III, mousemouse

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc3P33622 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Apoc3P33622 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Tpra1-201ENSMUST00000055022 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Vapa-201ENSMUST00000024897 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Apoc3P33622 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms