Protein–RNA interactions for Protein: P33609

Pola1, DNA polymerase alpha catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola1P33609 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola1P33609 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola1P33609 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pola1P33609 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola1P33609 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola1P33609 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pola1P33609 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pola1P33609 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pola1P33609 Dpys-202ENSMUST00000110306 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pola1P33609 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pola1P33609 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Pola1P33609 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC25.2■■□□□ 1.63
Pola1P33609 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Pola1P33609 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pola1P33609 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms