Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Nedd1P33215 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Gnb2-204ENSMUST00000111027 1610 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Nedd1P33215 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Nedd1P33215 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms