Protein–RNA interactions for Protein: P29452

Casp1, Caspase-1, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casp1P29452 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp1P29452 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp1P29452 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp1P29452 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp1P29452 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Casp1P29452 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp1P29452 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp1P29452 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Bicdl1-203ENSMUST00000118576 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp1P29452 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Gm3020-202ENSMUST00000167430 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Gm10409-201ENSMUST00000170123 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Nfatc2-201ENSMUST00000029057 2310 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp1P29452 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Casp1P29452 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms