Protein–RNA interactions for Protein: P28235

Gja4, Gap junction alpha-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja4P28235 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Lsp1-202ENSMUST00000038946 1828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Lrch3-208ENSMUST00000165616 1875 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Alg1-202ENSMUST00000100196 1755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Echs1-201ENSMUST00000026538 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja4P28235 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Klhdc4-205ENSMUST00000174192 1584 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja4P28235 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gja4P28235 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gja4P28235 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms