Protein–RNA interactions for Protein: P27664

Pde6a, Rod cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha, mousemouse

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Length 859 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6aP27664 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Pde6aP27664 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Mdfic-202ENSMUST00000120512 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Pde6aP27664 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Cyp2u1-203ENSMUST00000200236 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Pde6aP27664 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.3 ms