Protein–RNA interactions for Protein: P27641

Xrcc5, X-ray repair cross-complementing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc5P27641 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Thumpd2-201ENSMUST00000025093 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Gm26634-201ENSMUST00000181146 1511 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
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Xrcc5P27641 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Xrcc5P27641 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
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Xrcc5P27641 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Xrcc5P27641 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Xrcc5P27641 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
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Xrcc5P27641 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
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Xrcc5P27641 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
Xrcc5P27641 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.64■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Xrcc5P27641 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
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